學校沿革

1. 本校原名為台灣糖業公司灣裡糖廠員工子弟學校，設立於民國三十六年三月，借用糖廠被炸之員工宿舍改建為校舍。由灣裡廠廠長沈慶熊先生兼任首任校長。
2. 民國三十七年奉台糖公司令：先後兩次更改校名為台糖第九小學、第六小學。
3. 民國三十八年二月奉台灣省教育廳令：改名為台南縣善化鎮灣裡代用國民學校。
4. 民國五十三年三月十二日奉台南縣政府 53．3．6 南府教國字第一二四○七號令：更改校名為台南縣善化鎮善糖代用國民學校。
5. 民國五十七年八月學校改制，移轉台南縣政府接辦，是年十月十二日，奉台南縣政府 57．10．4 南府教國字第七八八三八號令，改名為台南縣善化鎮善糖國民小學。
6. 民國六十三年十月十八日奉縣政府令：附設幼稚班。
7. 民國 99 年 12 月 25 日縣市合併改制直轄市後更名為 臺南市善化區善糖國民小學。首任校長由陳俊吉校長擔任。
8. 民國 106 年度善糖國小老舊校舍重建工程，民國 107 年 3 月 8 日動工，108年 12 月 17 日正式驗收完工。

    總工程款： 62100000 元

    設計監造：解構聯合建築師事務所

    營造單位：城邦營造有限公司